端粒长度

HiFi测序:单碱基分辨率的高通量端粒长度测量方法

  端粒是线状染色体末端的特殊核蛋白结构,包含约5-15 kb的富含TTAGGG的双链重复序列和保护染色体末端的shelterin蛋白复合物,3'末端为富含G的单链悬突,对于维持人类基因组的稳定和完整复制至关重要。

  端粒主要依赖端粒酶进行合成,长度也并非一成不变。除了生殖细胞和干细胞,体细胞由于端粒酶活性的缺乏会导致每次细胞分裂时端粒逐渐缩短(约50-200 bp)。研究表明外周血单核细胞

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Science子刊:揭示一种调节癌细胞端粒维持长度的新机制

  端粒是由非编码DNA组成的染色体末端。当正常细胞分裂时,它们的端粒会变短,直到细胞不能再分裂。然而,癌细胞可以保持其端粒的长度,通过激活两种过程---端粒酶或端粒延伸替代(alternative lengthening of telomeres, ALT)通路---中的一种来无限期地延长其寿命。

  在一项新的研究中,来自美国凯斯西储大学和克利夫兰诊所的研究人员确定了端粒调节肿瘤的侵袭性和生存的新

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数字PCR新方法来测量端粒长度

STAR分析流程


目前,在诊断和确定端粒长度与数量异常上,标准方法是使用南方墨点法(Southern" />

近日,新加坡国立大学利用数字PCR技术,开发出一种新颖、快速的端粒测量方法—单端粒绝对长度快速分析法(SATR),可在临床环境中快速确定癌症和年龄相关疾病中的端粒酶异常,有助于临床医生更快地为患者进行诊断与计划治疗对策。相关研究日前已发表在《Science Advances 》期刊上。

STAR分析流程

目前,在诊断和确定端粒长度与数量异常上,标准方法是使用南方墨点法(Southern blot),

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血病相关的基因突变及临床解释--POT1基因

这个基因是端粒家族的成员,编码一种参与端粒维持的核蛋白。具体来说,这种蛋白作为一种多蛋白复合物的成员发挥作用,该复合物结合端粒的ttagg重复序列,调节端粒长度,保护染色体末端不受非法重组、灾难性染色体不稳定和异常染色体分离的影响。该基因转录表达的增加与胃癌的发生及其进展有关。另外,还描述了拼接转录变体。

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POT1基因的结构特点和作用

这个基因是端粒家族的成员,编码一种参与端粒维持的核蛋白。具体来说,这种蛋白作为一种多蛋白复合物的成员发挥作用,该复合物结合端粒的ttagg重复序列,调节端粒长度,保护染色体末端不受非法重组、灾难性染色体不稳定和异常染色体分离的影响。该基因转录表达的增加与胃癌的发生及其进展有关。另外,还描述了拼接转录变体。

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什么是引物延伸分析?

引物延伸分析(primer extension analysis)主要用于mRNA 5′端作图。poly(A)+RNA首先与过量5′端标记的且与靶RNA互补的单链寡核苷酸引物杂交,然后用反转录酶延伸这个引物。产生的cDNA与RNA模板互补且长度与引物5′端和RNA 5′端之间的距离相等。该法在mRNA 5′端作图方面具有下述优势:一旦引物被子起始合成,延伸反应大多会进行到RNA模板的5′最末端,产物

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