nucleotide+blast比对结果分析

测序结果的分析

测序都是从5'端进行的,正向和反向测序是指对DNA的两条互补链分别测序,通常两个方向测序结果经校读后完全一致才能认为得到可靠结果。生工测序结果一般都提供两个文档,一个是TEXT的序列文档,一个是用Chromas软件打开的ABI文档。

1.寻找引物

http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 比对,去除引物序列,找到目的片段。

在DNAMan上进行

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一步步教你利用Blast分析验证引物序列

引物设计完成之后,需要用软件 进行分析,找到最佳的引物对,采用Blast分析验证引物,可以知道序列的正确性,也能知道引物的特异性状况、引物的具体位置以及PCR产物的大小。

先找到需要设计引物的目标基因的在有引物序列的mRNA序列,可以通过全文(如最先发现该基因的文章),全文中有时可以找到大鼠c-jun mRNA序列的ACCESSION NUMBER,在PubMed中的“Nucleotide”中用此AC

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一步步教你利用Blast分析验证引物序列

引物设计完成之后,需要用软件 进行分析,找到最佳的引物对,采用Blast分析验证引物,可以知道序列的正确性,也能知道引物的特异性状况、引物的具体位置以及PCR产物的大小。

先找到需要设计引物的目标基因的在有引物序列的mRNA序列,可以通过全文(如最先发现该基因的文章),全文中有时可以找到大鼠c-jun mRNA序列的ACCESSION NUMBER,在PubMed中的“Nucleotide”中用此AC

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