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iTRAQ定量蛋白质组学技术分析抗菌肽F1的抗菌机制研究

  本研究利用iTRAQ定量蛋白质组学分析技术,对抗菌肽F1处理的大肠杆菌及空白对照在不同时间段菌体的生长速率以及其产生的蛋白质进行了分析与鉴定,通过比较实验组与对照组蛋白质表达水平差异,以期了解抗菌肽F1的抗菌机制。

  抗菌肽在农业和食品工业中受到越来越多的关注,因为它们具有控制病原体的潜力。然而,为了促进开发新型的基于活性肽类的抗微生物制剂,需要深入了解关于这些肽段的抗菌分子机制的细节。

  本研

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基于iTRAQ技术鉴定梭子蟹中与生长相关的差异表达蛋白

  梭子蟹广泛分布在韩国,日本,中国和东南亚的沿海水域。这种物种栖息在河口和沿海水域。 在中国,它是一种主要的食用蟹种和重要的渔业资源,也是中国重要的养殖物种。目前关于梭子蟹的研究已经很广泛,但关于其遗传背景信息的研究亟待深入。目前为止,关于梭子蟹蛋白质组学的研究比较少。

  在这项研究中,中国水产科学院李健课题组利用iTRAQ蛋白质组定量分析技术对梭子蟹中与生长相关的蛋白质组进行了分析与鉴定,以了解

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蛋白质定量技术――iTRAQ

摘要:同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术是近年来最新开发的一种新的蛋白质组学定量研究技术,具有较好的定量效果、较高的重复性,并可对多达四种不同样本同时进行定量分析。研究人员采用iTRAQ蛋白质定量技术加速蛋白质的定量研究,当然这门新兴的工具仍然需要进一步的完善。   

仅仅知道蛋白质的身份并不足以对蛋白质给出最终定论,因为蛋白质的浓度对于实现其在细胞中的功能来说

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10标串联质谱标签(TMT)能更快速定量肿瘤蛋白

  在过去十年中,基因组学研究已经系统绘制了人类癌症的遗传改变,但这些改变对蛋白质组的直接影响还知之甚少。NIH临床蛋白质组学肿瘤分析联盟(CPTAC)的蛋白组学研究表明,将蛋白质组和磷酸化蛋白质组数据与基因组数据相整合,才能改善癌症通路的鉴定。

图片来源于网络

  然而,实体瘤组织在组成上比细胞系要复杂得多,至少包含了上皮、基质和血液成分。人们需要更复杂且更耗时的方案来处理实体瘤组织,才能检测到低丰度

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Nature Protocols 快速重复地对肿瘤蛋白进行深度分析和定量

  Broad研究所蛋白质组学平台的研究人员近日在《Nature Protocols》杂志上报道了一个经过优化的新流程,能够快速且重复地对肿瘤蛋白进行深度分析和定量。

  在过去十年中,基因组学研究已经系统绘制了人类癌症的遗传改变,但这些改变对蛋白质组的直接影响还知之甚少。NIH临床蛋白质组学肿瘤分析联盟(CPTAC)的蛋白组学研究表明,将蛋白质组和磷酸化蛋白质组数据与基因组数据相整合,才能改善癌症通

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timsTOF Pro和PASEF一双慧眼 探究更多组学奥秘

  离子淌度技术发展几十年,布鲁克这个致力于挑战极限的公司,2016年一出手就推出业界最高淌度分辨的timsTOF质谱,在完成硬件的挑战后,布鲁克同德国马普研究所的Matthias Mann合作PASEF技术,于去年HUPO推出了timsTOF Pro,在蛋白质组学领域刷新了“鸟枪”法鉴定的速度、灵敏度和深度覆盖率的记录。今年ASMS上,分析测试百科网采访到布鲁克•道尔顿蛋白质组学副总裁Gary K

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